Molekulare Dekodierung und therapeutische Überwindung präexistierender und adaptiver Resistenzmechanismen im Glioblastom

Anbieter der Doktorarbeit

Beschreibung der Arbeit

• Zellkulturtechniken: Kultivierung von Glioblastomzellen in unterschiedlichen Modellen • Funktionelle in vitro-Analysen: Planung und Durchführung zellbasierter Experimente • Mikroskopische Auswertung genetischer und pharma-kologischer Perturbationen zur Phänotyp-Korrelation • Molekularbiologische und proteinchemische Methoden: PCR, Isolation von Nukleinsäuren und Proteinen, Western Blot • Anwendung räumlicher Omics-Methoden zur Validierung von RNA- und Protein-Biomarkern in humanem und murinem Gewebe & Erfassung multikolorierter Färbungen am Mikroskop • Bei Interesse: Primäre tierexperimentelle Modelle des Glioms • Code-Entwicklung und Analyse bildbasierter Screenings sowie von Omics-Daten ➡ Die Methoden hören sich zunächst nach viel und komplex und kompliziert an, sind aber wirklich kein Hexenwerk ;) Es erfolgt eine gründliche Einarbeitung und fortwährende Hilfestellung und Begleitung durch mich oder Kollegen, die mit den Protokollen vertraut sind.

Die Klinische Kooperationseinheit Neuroonkologie am DKFZ unter der Leitung von Prof. Dr. Wolfgang Wick (https://www.dkfz.de/neuroonkologie) widmet sich der umfassenden Charakterisierung von Glioblastom-(GB)-Zellsubpopulationen in Bezug auf morphologische, funktionelle und molekulare Eigenschaften sowie deren Interaktionen mit gesunden Zelltypen. Ein zentrales Anliegen unserer Arbeitsgruppe ist es, wissenschaftliche präklinische Erkenntnisse rasch in eine klinische Anwendung zu überführen. Im Rahmen des ausgeschriebenen Projekts untersucht die Kandidatin bzw. der Kandidat bereits vorselektierte Marker von GB-Zellen und gesunden Gehirnzellen und analysiert deren Verhalten unter gezielten therapeutischen Interventionen im longitudinalen Verlauf. Hierzu kommen moderne zellbasierte Funktionsassays, hoch-auflösende Mikroskopieverfahren sowie multi-omische Analysen zum Einsatz, die projektbegleitend weiterentwickelt und methodisch optimiert werden.

Rahmenbedingungen

• Hauptbetreuung durch Herrn Dr. Dirk Hoffmann, mit dem auch die Planung und Strukturierung des Projekts erfolgt • Einbettung in ein herzliches, unterstützendes, ambitioniertes, internationales und cooles Team, in dem Experten für die verschiedenen Methoden jederzeit vor Ort oder remotely ansprechbar sind (https://www.dkfz.de/neuroonkologie) • Praktische Einarbeitung im Wet-Lab in etablierte Protokolle • Regelmäßige Präsentation und Feedback in den wöchentlichen Labormeetings unserer Gruppe

• 2 Freisemester • Fähigkeit zur Zusammenarbeit und Teamarbeit • Hohe intrinsische Motivation moderne Methoden zu entwickeln und in der translationalen neuroonkologischen Krebsforschung anzuwenden – zu Beginn gemeinsam unter Betreuung und im Verlauf zunehmend selbstständiger

• Finanzielle Unterstützung im Rahmen einer HiWi-Stelle oder eines Stipendiums • Unterstützung bei der Beantragung von Stipendien

• Co-Autorenschaft sicher • Erstautorenschaft möglich

• Eine vorheriges „gegenseitiges Beschnuppern“ im Rahmen eines HiWis in Teilzeit ist möglich • Bewerbungen bitte an Dirk Hoffmann senden: dirk.hoffmann@dkfz-heidelberg.de